به دنبال تزريق واكسن عوارض موضعي از قبيل قرمزي محل تزريق ، حساسيت موضع ، و گاهي واكنشهاي عمومي مانند تب ، سر درد ، و گاهي ظهور بثوراتي در سطح بدن مشاهده مي شود،. در موارد نادري به دنبال تزريق واكسن ناراحتي هاي كليوي و عصبي ديده شده است اگر ناراحتي عصبي ويا تشنجي كودك یا تب بالا، تشنج، و گريههاي شديد و ظرف 3 روز پس از تزريق مشاهده شودباید به پزشک مراجعه کرد!
یک مطالعه جدید نشان می دهد در بسیاری از موارد واکسیناسیون در کودکان سبب نقص ژنتیکی در آن ها می شود.تا پنج درصد از همه کودکان نو پا حداقل یک تب (تب عارضه جانبی معمول و شناخته شده از دریافت یک شات واکسیناسیون است) و تشنج را تجربه می کنند و گاهی اوقات این تشنج با از دست دادن هوشیاری همراه است.
تشنج بین سنین 6 ماه تا 5 سال در کودکان رخ می دهد، که این اتفاق همزمان با بخش زیادی از برنامه واکسیناسیون رخ می دهد. طرفداران ضد واکسیناسیون نشان می دهند که واکسیناسیون در دوران کودکی ممکن است به تشنج، صرع و دیگر بیماری ها منجر شود.
در سال 2012، یک مطالعه بزرگ انجام شده در دانمارک نشان داد خطر ابتلا صرع و تشنج با انجام واکسیناسون در نوزادان افزایش یافت.
برای این مطالعه، یک تیم از دانشمندان هلندی با بررسی و داده های پزشکی 990 کودک مبتلا به تشنج پس از واکسیناسیون در دو سال اول زندگی دریافتند والدینی که سابقه صرع و یا تشنج شدید دارند باید برنامه ریزی آگاهانه ای برای واکسیناسیون فرزندانشان داشته باشند و پزشکان توصیه می کنند قبل از انجام واکسیناسیون در نوزادان حتما به متخصص اطفال مراجعه شود.